Phú Thứ là một xã trung du miền núi nằm ở phía Đông Bắc của huyện Đoan Hùng; Phía Đông giáp xã Vân Sơn, Sơn Dương, Tuyên Quang, phía Tây tiếp giáp xã Đại Nghĩa, huyện Đoan Hùng , phía Nam giáp dòng sông Lô lịch sử, phía Bắc giáp xã Quyết Thắng, huyện Sơn Dương, Tỉnh Tuyên Quang. Xã cách trung tâm huyện 5 km.
Về địa lý xã Phú Thứ có nhiều điều kiện thuận lợi, hệ thống đường giao thông nông thôn thuận tiện để nhân dân phát triển kinh tế và sản xuất kinh doanh, giao lưu, phát triển với các xã trong và ngoài huyện.
Tổng diện tích tự nhiên của xã là 530,01ha, trong đó đất nông nghiệp là 400,62ha, chiếm 75,52%, đất phi nông nghiệp 114,04ha, chiếm 21,50%, đất chưa sử dụng 15,84ha, chiếm 2,98%.
Toàn xã có 2.300 nhân khẩu, dân tộc Kinh chiếm 95%; Ngoài ra còn các dân tộc khác như Tày, Mường, Cao Lan. Số người trong độ tuổi lao động khoảng 1.270 người, chiếm 57,4% dân số, trong đó số lao động trẻ chiếm 65%, lao động qua đào tạo trên 40%; Tỷ lệ phát triển dân số tự nhiên 0,87%.
Đơn vị hành chính Phú Thứ có 07 khu dân cư và 11 chi bộ, trong đó 7 chi bộ nông nghiệp, 3 chi bộ nhà trường và 1 chi bộ trạm y tế trực thuộc đảng bộ xã, có tổng số 108 đảng viên sinh hoạt trong các chi bộ.
Về phát triển kinh tế - xã hội, tình hình an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội luôn ổn định, quốc phòng an ninh được giữ vững, một số ngành sản xuất chính có dấu hiệu phục hồi như lĩnh vực chăn nuôi, nuôi trồng thủy sản,... Cơ sở hạ tầng tiếp tục được đầu tư xây dựng, các chính sách của nhà nước, của tỉnh ban hành kịp thời đã phát huy tác dụng, chế độ an sinh xã hội đảm bảo.
Bình quân lương thực đầu người đạt 352kg/người/năm. Tổng giá trị thu nhập bằng tiền 18 triệu/người/năm. Tỷ lệ hộ nghèo giảm còn 8,7%. Đến nay đã có 12/19 tiêu chí về xây dựng nông thôn mới.